1、客体不同：
专利保护技术内容，包括发明、使用新型与外观设计。商标保护商标本身，比如图形、文字、它们的组合或者立体商标。
2、期限不同：
专利保护期有限，发明20年，新型和外观设计10年，到期不能续展。商标保护10年，但是到期可以续展，因此只要每10年续展一次就可以无限期拥有商标独占使用权。
3、申请程序不同：
专利要向国家知识产权局专利局申请，经过初步审查（新型和外观）和实质审查（发明），最终授予专利权。注册公司商标向国家工商总局商标局申请，经过初步审查，公告无异议后核准注册。
4、保护内容不同：
专利保护的是不得制造、使用、许诺销售、销售与进口同该专利相同或近似的产品。注册公司商标保护的是不得在同类商品上注册相同的商标，如果受保护的是驰名商标，他人即使是不同类商品也不能标注注册公司驰名商标。
